Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LMOD3Q0VAK6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LMOD3Q0VAK6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LMOD3Q0VAK6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LMOD3Q0VAK6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LMOD3Q0VAK6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LMOD3Q0VAK6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LMOD3Q0VAK6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LMOD3Q0VAK6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LMOD3Q0VAK6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LMOD3Q0VAK6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
LMOD3Q0VAK6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
LMOD3Q0VAK6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
LMOD3Q0VAK6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
LMOD3Q0VAK6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
LMOD3Q0VAK6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
LMOD3Q0VAK6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LMOD3Q0VAK6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LMOD3Q0VAK6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LMOD3Q0VAK6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LMOD3Q0VAK6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LMOD3Q0VAK6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LMOD3Q0VAK6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LMOD3Q0VAK6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LMOD3Q0VAK6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LMOD3Q0VAK6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LMOD3Q0VAK6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
LMOD3Q0VAK6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LMOD3Q0VAK6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LMOD3Q0VAK6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LMOD3Q0VAK6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LMOD3Q0VAK6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
LMOD3Q0VAK6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LMOD3Q0VAK6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LMOD3Q0VAK6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
LMOD3Q0VAK6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LMOD3Q0VAK6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LMOD3Q0VAK6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LMOD3Q0VAK6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LMOD3Q0VAK6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LMOD3Q0VAK6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
LMOD3Q0VAK6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LMOD3Q0VAK6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LMOD3Q0VAK6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LMOD3Q0VAK6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMOD3Q0VAK6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMOD3Q0VAK6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMOD3Q0VAK6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMOD3Q0VAK6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMOD3Q0VAK6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
LMOD3Q0VAK6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LMOD3Q0VAK6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LMOD3Q0VAK6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LMOD3Q0VAK6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
LMOD3Q0VAK6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
LMOD3Q0VAK6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMOD3Q0VAK6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMOD3Q0VAK6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMOD3Q0VAK6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMOD3Q0VAK6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMOD3Q0VAK6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMOD3Q0VAK6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMOD3Q0VAK6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMOD3Q0VAK6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LMOD3Q0VAK6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LMOD3Q0VAK6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMOD3Q0VAK6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMOD3Q0VAK6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LMOD3Q0VAK6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LMOD3Q0VAK6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LMOD3Q0VAK6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LMOD3Q0VAK6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
LMOD3Q0VAK6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMOD3Q0VAK6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
LMOD3Q0VAK6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMOD3Q0VAK6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMOD3Q0VAK6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMOD3Q0VAK6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LMOD3Q0VAK6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMOD3Q0VAK6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMOD3Q0VAK6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMOD3Q0VAK6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMOD3Q0VAK6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
LMOD3Q0VAK6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LMOD3Q0VAK6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LMOD3Q0VAK6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LMOD3Q0VAK6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LMOD3Q0VAK6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LMOD3Q0VAK6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LMOD3Q0VAK6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
LMOD3Q0VAK6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LMOD3Q0VAK6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
LMOD3Q0VAK6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
LMOD3Q0VAK6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
LMOD3Q0VAK6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
LMOD3Q0VAK6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
LMOD3Q0VAK6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LMOD3Q0VAK6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
LMOD3Q0VAK6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LMOD3Q0VAK6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms