Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r181Q0P547 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r181Q0P547 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r181Q0P547 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r181Q0P547 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r181Q0P547 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r181Q0P547 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r181Q0P547 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r181Q0P547 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r181Q0P547 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r181Q0P547 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r181Q0P547 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r181Q0P547 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmn1r181Q0P547 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms