Protein–RNA interactions for Protein: Q08412

CUE5, Ubiquitin-binding protein CUE5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE5Q08412 CDC16YKL022C 2523 nt7.05□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 PUP2YGR253C 783 nt7.05□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 YAL045CYAL045C 309 nt7.05□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 NAF1YNL124W 1479 nt7.04□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 MRPL28YDR462W 444 nt7.04□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 HHY1YEL059W 309 nt7.04□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 ARC35YNR035C 1029 nt7.04□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 ERS1YCR075C 783 nt7.03□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 YIP4YGL198W 708 nt7.03□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 YNR005CYNR005C 405 nt7.02□□□□□ -1.29
CUE5Q08412 YCL049CYCL049C 939 nt7.02□□□□□ -1.29
CUE5Q08412 ADE17YMR120C 1779 nt7.02□□□□□ -1.29
CUE5Q08412 SRF1YDL133W 1314 nt7.01□□□□□ -1.29
CUE5Q08412 MCH2YKL221W 1422 nt7.01□□□□□ -1.29
CUE5Q08412 RPR1RPR1 369 nt7.01□□□□□ -1.29
CUE5Q08412 YOL099CYOL099C 492 nt7.01□□□□□ -1.29
CUE5Q08412 ATP4YPL078C 735 nt7.01□□□□□ -1.29
CUE5Q08412 TUF1YOR187W 1314 nt7.01□□□□□ -1.29
CUE5Q08412 MFG1YDL233W 1377 nt7□□□□□ -1.29
CUE5Q08412 YLR162WYLR162W 357 nt7□□□□□ -1.29
CUE5Q08412 HTZ1YOL012C 405 nt7□□□□□ -1.29
CUE5Q08412 NTG2YOL043C 1143 nt7□□□□□ -1.29
CUE5Q08412 CYB2YML054C 1776 nt6.99□□□□□ -1.29
CUE5Q08412 YBR241CYBR241C 1467 nt6.98□□□□□ -1.29
CUE5Q08412 AIM46YHR199C 933 nt6.98□□□□□ -1.29
CUE5Q08412 REC107YJR021C 945 nt6.98□□□□□ -1.29
CUE5Q08412 PRP2YNR011C 2631 nt6.98□□□□□ -1.29
CUE5Q08412 SNU71YGR013W 1863 nt6.97□□□□□ -1.29
CUE5Q08412 YOX1YML027W 1158 nt6.97□□□□□ -1.29
CUE5Q08412 POX1YGL205W 2247 nt6.97□□□□□ -1.29
CUE5Q08412 YNL017CYNL017C 339 nt6.96□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 AIM3YBR108W 2844 nt6.95□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 LAT1YNL071W 1449 nt6.95□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 URH1YDR400W 1023 nt6.95□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 NTG1YAL015C 1200 nt6.95□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.95□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.95□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.95□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.95□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 RPL31BYLR406C 342 nt6.95□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 KIN1YDR122W 3195 nt6.95□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 PPS1YBR276C 2424 nt6.95□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 SEC23YPR181C 2307 nt6.94□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 APE4YHR113W 1473 nt6.94□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 HBN1YCL026C-B 582 nt6.94□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 PAC2YER007W 1557 nt6.94□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 TAH11YJR046W 1815 nt6.94□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 MAK32YCR019W 1092 nt6.93□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 PTC7YHR076W 1032 nt6.93□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 CBR1YIL043C 855 nt6.93□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 SPG5YMR191W 1122 nt6.93□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 CCT3YJL014W 1605 nt6.93□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 NSE5YML023C 1671 nt6.93□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 VBA5YKR105C 1749 nt6.93□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 YLL058WYLL058W 1728 nt6.93□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 EFM1YHL039W 1758 nt6.92□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 ATF1YOR377W 1578 nt6.92□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 RPL2BYIL018W 765 nt6.92□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 FET4YMR319C 1659 nt6.92□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 GSH1YJL101C 2037 nt6.91□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 YPL247CYPL247C 1572 nt6.91□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 RGD2YFL047W 2145 nt6.91□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 TRS31YDR472W 852 nt6.91□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 YGL102CYGL102C 429 nt6.91□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 ZIM17YNL310C 525 nt6.91□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 GDA1YEL042W 1557 nt6.91□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 MRPS28YDR337W 861 nt6.9□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 SMX3YPR182W 261 nt6.9□□□□□ -1.3
CUE5Q08412 JIP4YDR475C 2631 nt6.89□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 RRP46YGR095C 672 nt6.89□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 SML1YML058W 315 nt6.89□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 HOG1YLR113W 1308 nt6.89□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 GPH1YPR160W 2709 nt6.88□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 DAL4YIR028W 1908 nt6.88□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 YJL163CYJL163C 1668 nt6.88□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 ICP55YER078C 1536 nt6.88□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.88□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 YNR014WYNR014W 639 nt6.88□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 YPL277CYPL277C 1464 nt6.87□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 RQC1YDR333C 2172 nt6.87□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 YDL177CYDL177C 513 nt6.87□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 PRI1YIR008C 1230 nt6.87□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 COX16YJL003W 357 nt6.87□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 YLL056CYLL056C 897 nt6.87□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 ERG10YPL028W 1197 nt6.87□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 ICL2YPR006C 1728 nt6.87□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 YMR034CYMR034C 1305 nt6.86□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 FZF1YGL254W 900 nt6.86□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 FAF1YIL019W 1041 nt6.86□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 MSC3YLR219W 2187 nt6.86□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 BUD9YGR041W 1644 nt6.86□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 EDC3YEL015W 1656 nt6.85□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 CHS5YLR330W 2016 nt6.85□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 TRR1YDR353W 960 nt6.85□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 MRPL19YNL185C 477 nt6.85□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 YOL046CYOL046C 675 nt6.85□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 FIT2YOR382W 462 nt6.85□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 SEC62YPL094C 825 nt6.85□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 YPR076WYPR076W 375 nt6.85□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 YFR006WYFR006W 1608 nt6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.1 ms