Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNB2Q08289 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNB2Q08289 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNB2Q08289 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNB2Q08289 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNB2Q08289 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNB2Q08289 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNB2Q08289 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNB2Q08289 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNB2Q08289 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CACNB2Q08289 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CACNB2Q08289 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNB2Q08289 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNB2Q08289 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNB2Q08289 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNB2Q08289 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNB2Q08289 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNB2Q08289 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNB2Q08289 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNB2Q08289 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNB2Q08289 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNB2Q08289 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNB2Q08289 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNB2Q08289 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNB2Q08289 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNB2Q08289 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNB2Q08289 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNB2Q08289 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNB2Q08289 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNB2Q08289 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNB2Q08289 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNB2Q08289 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNB2Q08289 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNB2Q08289 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNB2Q08289 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNB2Q08289 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNB2Q08289 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNB2Q08289 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNB2Q08289 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CACNB2Q08289 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CACNB2Q08289 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CACNB2Q08289 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CACNB2Q08289 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms