Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cdx4Q07424 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdx4Q07424 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms