Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTDSPL2Q05D32 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTDSPL2Q05D32 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTDSPL2Q05D32 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTDSPL2Q05D32 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTDSPL2Q05D32 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CTDSPL2Q05D32 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTDSPL2Q05D32 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTDSPL2Q05D32 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTDSPL2Q05D32 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTDSPL2Q05D32 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTDSPL2Q05D32 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTDSPL2Q05D32 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTDSPL2Q05D32 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTDSPL2Q05D32 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTDSPL2Q05D32 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTDSPL2Q05D32 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CTDSPL2Q05D32 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTDSPL2Q05D32 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTDSPL2Q05D32 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTDSPL2Q05D32 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTDSPL2Q05D32 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTDSPL2Q05D32 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTDSPL2Q05D32 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTDSPL2Q05D32 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTDSPL2Q05D32 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTDSPL2Q05D32 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTDSPL2Q05D32 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CTDSPL2Q05D32 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTDSPL2Q05D32 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTDSPL2Q05D32 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTDSPL2Q05D32 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTDSPL2Q05D32 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTDSPL2Q05D32 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTDSPL2Q05D32 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTDSPL2Q05D32 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTDSPL2Q05D32 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CTDSPL2Q05D32 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CTDSPL2Q05D32 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms