Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Caprin2Q05A80 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Caprin2Q05A80 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Caprin2Q05A80 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Caprin2Q05A80 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Caprin2Q05A80 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Caprin2Q05A80 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Caprin2Q05A80 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Caprin2Q05A80 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Caprin2Q05A80 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Caprin2Q05A80 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Caprin2Q05A80 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms