Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PtprgQ05909 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PtprgQ05909 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PtprgQ05909 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PtprgQ05909 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PtprgQ05909 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PtprgQ05909 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PtprgQ05909 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PtprgQ05909 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PtprgQ05909 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PtprgQ05909 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PtprgQ05909 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PtprgQ05909 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PtprgQ05909 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PtprgQ05909 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PtprgQ05909 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PtprgQ05909 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
PtprgQ05909 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PtprgQ05909 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PtprgQ05909 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PtprgQ05909 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PtprgQ05909 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PtprgQ05909 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PtprgQ05909 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PtprgQ05909 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PtprgQ05909 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PtprgQ05909 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PtprgQ05909 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PtprgQ05909 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PtprgQ05909 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
PtprgQ05909 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PtprgQ05909 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtprgQ05909 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtprgQ05909 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtprgQ05909 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtprgQ05909 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtprgQ05909 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PtprgQ05909 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PtprgQ05909 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PtprgQ05909 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PtprgQ05909 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PtprgQ05909 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PtprgQ05909 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PtprgQ05909 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PtprgQ05909 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PtprgQ05909 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PtprgQ05909 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PtprgQ05909 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PtprgQ05909 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PtprgQ05909 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PtprgQ05909 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PtprgQ05909 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PtprgQ05909 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PtprgQ05909 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PtprgQ05909 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PtprgQ05909 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PtprgQ05909 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PtprgQ05909 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PtprgQ05909 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PtprgQ05909 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PtprgQ05909 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PtprgQ05909 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PtprgQ05909 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PtprgQ05909 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
PtprgQ05909 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
PtprgQ05909 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PtprgQ05909 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PtprgQ05909 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
PtprgQ05909 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PtprgQ05909 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PtprgQ05909 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprgQ05909 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprgQ05909 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprgQ05909 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprgQ05909 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprgQ05909 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprgQ05909 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
PtprgQ05909 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PtprgQ05909 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PtprgQ05909 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
PtprgQ05909 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PtprgQ05909 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
PtprgQ05909 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PtprgQ05909 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PtprgQ05909 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PtprgQ05909 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprgQ05909 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprgQ05909 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprgQ05909 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PtprgQ05909 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
PtprgQ05909 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PtprgQ05909 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PtprgQ05909 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PtprgQ05909 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PtprgQ05909 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PtprgQ05909 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
PtprgQ05909 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PtprgQ05909 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PtprgQ05909 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PtprgQ05909 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms