Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RELQ04864 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RELQ04864 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RELQ04864 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RELQ04864 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RELQ04864 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RELQ04864 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RELQ04864 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RELQ04864 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RELQ04864 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RELQ04864 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RELQ04864 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RELQ04864 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RELQ04864 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RELQ04864 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RELQ04864 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RELQ04864 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RELQ04864 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RELQ04864 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RELQ04864 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RELQ04864 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RELQ04864 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RELQ04864 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RELQ04864 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RELQ04864 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RELQ04864 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RELQ04864 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RELQ04864 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RELQ04864 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RELQ04864 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RELQ04864 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RELQ04864 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RELQ04864 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RELQ04864 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RELQ04864 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RELQ04864 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RELQ04864 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RELQ04864 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RELQ04864 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RELQ04864 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RELQ04864 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RELQ04864 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RELQ04864 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RELQ04864 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RELQ04864 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RELQ04864 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RELQ04864 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RELQ04864 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RELQ04864 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RELQ04864 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RELQ04864 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RELQ04864 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RELQ04864 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RELQ04864 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RELQ04864 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RELQ04864 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RELQ04864 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RELQ04864 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RELQ04864 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELQ04864 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELQ04864 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELQ04864 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELQ04864 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELQ04864 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELQ04864 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELQ04864 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELQ04864 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELQ04864 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELQ04864 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELQ04864 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELQ04864 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELQ04864 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELQ04864 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELQ04864 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELQ04864 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELQ04864 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELQ04864 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RELQ04864 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELQ04864 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELQ04864 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELQ04864 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELQ04864 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELQ04864 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RELQ04864 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RELQ04864 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RELQ04864 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RELQ04864 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELQ04864 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELQ04864 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELQ04864 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELQ04864 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELQ04864 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELQ04864 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RELQ04864 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RELQ04864 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RELQ04864 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RELQ04864 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RELQ04864 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RELQ04864 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RELQ04864 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms