Protein–RNA interactions for Protein: Q04749

AVO2, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO2, yeastyeast

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO2Q04749 YPL247CYPL247C 1572 nt5.68□□□□□ -1.5
AVO2Q04749 YPR204WYPR204W 3099 nt5.68□□□□□ -1.5
AVO2Q04749 GEF1YJR040W 2340 nt5.68□□□□□ -1.5
AVO2Q04749 NMD5YJR132W 3147 nt5.68□□□□□ -1.5
AVO2Q04749 NAF1YNL124W 1479 nt5.67□□□□□ -1.5
AVO2Q04749 CIS3YJL158C 684 nt5.67□□□□□ -1.5
AVO2Q04749 YJR107WYJR107W 987 nt5.67□□□□□ -1.5
AVO2Q04749 GCN3YKR026C 918 nt5.67□□□□□ -1.5
AVO2Q04749 SES1YDR023W 1389 nt5.67□□□□□ -1.5
AVO2Q04749 IMA5YJL216C 1746 nt5.66□□□□□ -1.5
AVO2Q04749 YGL081WYGL081W 963 nt5.66□□□□□ -1.5
AVO2Q04749 MSI1YBR195C 1269 nt5.66□□□□□ -1.5
AVO2Q04749 GDH1YOR375C 1365 nt5.66□□□□□ -1.5
AVO2Q04749 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt5.65□□□□□ -1.5
AVO2Q04749 ADE1YAR015W 921 nt5.65□□□□□ -1.5
AVO2Q04749 PEX13YLR191W 1161 nt5.65□□□□□ -1.5
AVO2Q04749 CYC8YBR112C 2901 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 PPM1YDR435C 987 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 TRS31YDR472W 852 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 HIS1YER055C 894 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 ACS1YAL054C 2142 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 PAM17YKR065C 594 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 RTC4YNL254C 1206 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 PUP1YOR157C 786 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 snR82snR82 268 nt5.63□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 QCR6YFR033C 444 nt5.63□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 ICS3YJL077C 396 nt5.63□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 COX5AYNL052W 462 nt5.63□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 LAG2YOL025W 1983 nt5.63□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 MIP1YOR330C 3765 nt5.63□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 EFT2YDR385W 2529 nt5.63□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 EFT1YOR133W 2529 nt5.63□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 TPO3YPR156C 1869 nt5.62□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 YKR032WYKR032W 315 nt5.62□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 YDR476CYDR476C 675 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 YML122CYML122C 381 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 POP1YNL221C 2628 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 RGD1YBR260C 2001 nt5.6□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 YLL058WYLL058W 1728 nt5.6□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 URH1YDR400W 1023 nt5.6□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 YIP4YGL198W 708 nt5.6□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 TOS6YNL300W 309 nt5.6□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 ATP23YNR020C 813 nt5.59□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 KEL1YHR158C 3495 nt5.59□□□□□ -1.51
AVO2Q04749 RSA4YCR072C 1548 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 NFS1YCL017C 1494 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 SKI2YLR398C 3864 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 MRP1YDR347W 966 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 YDR415CYDR415C 1125 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 YGR127WYGR127W 939 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 DUS4YLR405W 1104 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 YML6YML025C 861 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 CSC1YLR241W 2349 nt5.58□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 DOC1YGL240W 753 nt5.57□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 CBR1YIL043C 855 nt5.57□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 ERP2YAL007C 648 nt5.57□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 MPE1YKL059C 1326 nt5.56□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 YPQ2YDR352W 954 nt5.56□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 ASN2YGR124W 1719 nt5.56□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 PMT3YOR321W 2262 nt5.55□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 KTR5YNL029C 1569 nt5.55□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 YDL177CYDL177C 513 nt5.55□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 IRC11YOR013W 471 nt5.55□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 PLB2YMR006C 2121 nt5.54□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 COX9YDL067C 180 nt5.54□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 REC107YJR021C 945 nt5.54□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 RPL31BYLR406C 342 nt5.54□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 SPG5YMR191W 1122 nt5.54□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 YOS9YDR057W 1629 nt5.54□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 VHT1YGR065C 1782 nt5.54□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 RMD9YGL107C 1941 nt5.54□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 BRN1YBL097W 2265 nt5.54□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 ATG22YCL038C 1587 nt5.54□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 HEM1YDR232W 1647 nt5.53□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 GPI11YDR302W 660 nt5.53□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 YPT1YFL038C 621 nt5.53□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 OAC1YKL120W 975 nt5.53□□□□□ -1.52
AVO2Q04749 THI4YGR144W 981 nt5.52□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 YSC83YHR017W 1158 nt5.52□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 CRP1YHR146W 1398 nt5.52□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 ESC8YOL017W 2145 nt5.51□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 TUB1YML085C 1344 nt5.51□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 UTR2YEL040W 1404 nt5.51□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt5.51□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt5.51□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt5.51□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 SUP51tL(UAA)J 84 nt5.51□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt5.51□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt5.51□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt5.51□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 NTG2YOL043C 1143 nt5.51□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 YDR514CYDR514C 1452 nt5.51□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.5□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.5□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.5□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.5□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.5□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.7 ms