Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMX1Q04741 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMX1Q04741 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMX1Q04741 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMX1Q04741 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMX1Q04741 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMX1Q04741 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMX1Q04741 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMX1Q04741 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMX1Q04741 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMX1Q04741 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMX1Q04741 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EMX1Q04741 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms