Protein–RNA interactions for Protein: Q04201

CUE4, CUE domain-containing protein CUE4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE4Q04201 ERO1YML130C 1692 nt5.49□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 PSP2YML017W 1782 nt5.49□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 UTR2YEL040W 1404 nt5.48□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 YIL077CYIL077C 963 nt5.48□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 YNL092WYNL092W 1203 nt5.48□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 DSC3YOR223W 879 nt5.48□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 QNS1YHR074W 2145 nt5.48□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 HEM1YDR232W 1647 nt5.48□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 YPT1YFL038C 621 nt5.47□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 ICT1YLR099C 1185 nt5.47□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 LSP1YPL004C 1026 nt5.47□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 LSG1YGL099W 1923 nt5.46□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 PFK2YMR205C 2880 nt5.46□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 IVY1YDR229W 1362 nt5.46□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 PET117YER058W 324 nt5.46□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 YEL020CYEL020C 1683 nt5.45□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 PSA1YDL055C 1086 nt5.45□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 URH1YDR400W 1023 nt5.45□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 CYC3YAL039C 810 nt5.45□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 YMR206WYMR206W 942 nt5.45□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 MRPS12YNR036C 462 nt5.45□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 IRC11YOR013W 471 nt5.45□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 PAT1YCR077C 2391 nt5.45□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 YCR049CYCR049C 447 nt5.44□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 SKN1YGR143W 2316 nt5.44□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 PRY3YJL078C 2646 nt5.44□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 PSR2YLR019W 1194 nt5.44□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 SDH8YBR269C 417 nt5.44□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 CLB2YPR119W 1476 nt5.44□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 SKP1YDR328C 585 nt5.43□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 CCW12YLR110C 402 nt5.43□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 VPS5YOR069W 2028 nt5.43□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 LAT1YNL071W 1449 nt5.42□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 YDL177CYDL177C 513 nt5.42□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 DMC1YER179W 1005 nt5.42□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 IGD1YFR017C 588 nt5.42□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 FBA1YKL060C 1080 nt5.42□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 PTK2YJR059W 2457 nt5.42□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 MCM6YGL201C 3054 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 VPS61YDR136C 573 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 FLX1YIL134W 936 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 RPS6AYPL090C 711 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 RPS6BYBR181C 711 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 AMA1YGR225W 1782 nt5.41□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 ARA2YMR041C 1008 nt5.4□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 YBR113WYBR113W 483 nt5.4□□□□□ -1.54
CUE4Q04201 AIM3YBR108W 2844 nt5.4□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 FET4YMR319C 1659 nt5.4□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 MRPL1YDR116C 858 nt5.39□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 RPP1YHR062C 882 nt5.39□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 CBR1YIL043C 855 nt5.39□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 ALD6YPL061W 1503 nt5.38□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 YFL042CYFL042C 2025 nt5.38□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 THI2YBR240C 1353 nt5.38□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 DMA1YHR115C 1251 nt5.37□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 YJL213WYJL213W 996 nt5.37□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 Q0010Q0010 387 nt5.37□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 YPR084WYPR084W 1371 nt5.37□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 GPA1YHR005C 1419 nt5.37□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 NAS6YGR232W 687 nt5.36□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 STP3YLR375W 1032 nt5.36□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 DPM1YPR183W 804 nt5.36□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 PRP24YMR268C 1335 nt5.36□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 GPA2YER020W 1350 nt5.36□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 ATP2YJR121W 1536 nt5.36□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 YMR279CYMR279C 1623 nt5.36□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 MKK2YPL140C 1521 nt5.35□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 NFS1YCL017C 1494 nt5.35□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 YSC83YHR017W 1158 nt5.35□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 YLR123CYLR123C 330 nt5.35□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 CCC2YDR270W 3015 nt5.34□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 SQT1YIR012W 1296 nt5.34□□□□□ -1.55
CUE4Q04201 OSM1YJR051W 1506 nt5.33□□□□□ -1.56
CUE4Q04201 MKK1YOR231W 1527 nt5.33□□□□□ -1.56
CUE4Q04201 EDE1YBL047C 4146 nt5.33□□□□□ -1.56
CUE4Q04201 RHO4YKR055W 876 nt5.33□□□□□ -1.56
CUE4Q04201 YPR123CYPR123C 435 nt5.33□□□□□ -1.56
CUE4Q04201 YHL017WYHL017W 1599 nt5.33□□□□□ -1.56
CUE4Q04201 GYP8YFL027C 1494 nt5.32□□□□□ -1.56
CUE4Q04201 HSP104YLL026W 2727 nt5.32□□□□□ -1.56
CUE4Q04201 FMP40YPL222W 2067 nt5.32□□□□□ -1.56
CUE4Q04201 YBR124WYBR124W 360 nt5.32□□□□□ -1.56
CUE4Q04201 CIT2YCR005C 1383 nt5.31□□□□□ -1.56
CUE4Q04201 YMR034CYMR034C 1305 nt5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.6 ms