Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nucb1Q02819 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nucb1Q02819 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nucb1Q02819 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nucb1Q02819 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nucb1Q02819 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nucb1Q02819 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nucb1Q02819 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nucb1Q02819 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nucb1Q02819 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nucb1Q02819 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Nucb1Q02819 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nucb1Q02819 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nucb1Q02819 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nucb1Q02819 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Nucb1Q02819 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nucb1Q02819 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nucb1Q02819 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nucb1Q02819 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nucb1Q02819 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Nucb1Q02819 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nucb1Q02819 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nucb1Q02819 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nucb1Q02819 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nucb1Q02819 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nucb1Q02819 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nucb1Q02819 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nucb1Q02819 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nucb1Q02819 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nucb1Q02819 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nucb1Q02819 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nucb1Q02819 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nucb1Q02819 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nucb1Q02819 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nucb1Q02819 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nucb1Q02819 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nucb1Q02819 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nucb1Q02819 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nucb1Q02819 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms