Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRG1Q02297 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRG1Q02297 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRG1Q02297 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRG1Q02297 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRG1Q02297 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRG1Q02297 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRG1Q02297 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRG1Q02297 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRG1Q02297 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRG1Q02297 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRG1Q02297 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRG1Q02297 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRG1Q02297 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NRG1Q02297 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NRG1Q02297 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRG1Q02297 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRG1Q02297 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRG1Q02297 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRG1Q02297 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRG1Q02297 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRG1Q02297 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRG1Q02297 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRG1Q02297 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRG1Q02297 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRG1Q02297 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRG1Q02297 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.8 ms