Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnnb1Q02248 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnnb1Q02248 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnnb1Q02248 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnnb1Q02248 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnnb1Q02248 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnnb1Q02248 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnnb1Q02248 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnnb1Q02248 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnnb1Q02248 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnnb1Q02248 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnnb1Q02248 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnnb1Q02248 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnnb1Q02248 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnnb1Q02248 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctnnb1Q02248 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctnnb1Q02248 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnnb1Q02248 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnnb1Q02248 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnnb1Q02248 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnnb1Q02248 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnnb1Q02248 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnnb1Q02248 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms