Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Top2aQ01320 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
Top2aQ01320 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Top2aQ01320 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Top2aQ01320 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Top2aQ01320 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Top2aQ01320 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Top2aQ01320 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Top2aQ01320 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Top2aQ01320 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Top2aQ01320 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Top2aQ01320 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
Top2aQ01320 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Top2aQ01320 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Top2aQ01320 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Top2aQ01320 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Top2aQ01320 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Top2aQ01320 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
Top2aQ01320 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Top2aQ01320 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Top2aQ01320 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Top2aQ01320 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Top2aQ01320 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Top2aQ01320 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Top2aQ01320 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Top2aQ01320 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Top2aQ01320 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Top2aQ01320 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
Top2aQ01320 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Top2aQ01320 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Top2aQ01320 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Top2aQ01320 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Top2aQ01320 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Top2aQ01320 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Top2aQ01320 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
Top2aQ01320 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Top2aQ01320 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Top2aQ01320 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Top2aQ01320 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Top2aQ01320 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Top2aQ01320 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Top2aQ01320 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Top2aQ01320 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Top2aQ01320 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Top2aQ01320 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Top2aQ01320 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Top2aQ01320 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Top2aQ01320 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Top2aQ01320 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Top2aQ01320 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Top2aQ01320 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Top2aQ01320 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Top2aQ01320 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Top2aQ01320 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Top2aQ01320 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Top2aQ01320 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Top2aQ01320 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Top2aQ01320 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Top2aQ01320 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Top2aQ01320 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Top2aQ01320 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Top2aQ01320 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Top2aQ01320 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Top2aQ01320 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Top2aQ01320 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Top2aQ01320 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Top2aQ01320 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Top2aQ01320 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Top2aQ01320 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Top2aQ01320 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Top2aQ01320 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Top2aQ01320 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Top2aQ01320 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Top2aQ01320 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Top2aQ01320 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Top2aQ01320 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Top2aQ01320 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Top2aQ01320 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Top2aQ01320 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Top2aQ01320 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Top2aQ01320 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Top2aQ01320 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Top2aQ01320 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Top2aQ01320 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Top2aQ01320 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Top2aQ01320 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Top2aQ01320 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Top2aQ01320 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Top2aQ01320 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Top2aQ01320 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Top2aQ01320 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Top2aQ01320 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Top2aQ01320 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Top2aQ01320 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Top2aQ01320 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Top2aQ01320 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Top2aQ01320 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Top2aQ01320 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Top2aQ01320 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Top2aQ01320 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms