Protein–RNA interactions for Protein: Q01063

Pde4d, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4dQ01063 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pde4dQ01063 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pde4dQ01063 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pde4dQ01063 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pde4dQ01063 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms