Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CLTCQ00610 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
CLTCQ00610 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CLTCQ00610 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CLTCQ00610 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CLTCQ00610 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CLTCQ00610 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CLTCQ00610 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CLTCQ00610 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CLTCQ00610 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CLTCQ00610 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CLTCQ00610 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CLTCQ00610 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CLTCQ00610 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CLTCQ00610 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
CLTCQ00610 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CLTCQ00610 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CLTCQ00610 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
CLTCQ00610 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CLTCQ00610 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CLTCQ00610 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
CLTCQ00610 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CLTCQ00610 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CLTCQ00610 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CLTCQ00610 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
CLTCQ00610 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CLTCQ00610 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CLTCQ00610 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CLTCQ00610 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CLTCQ00610 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CLTCQ00610 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CLTCQ00610 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CLTCQ00610 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CLTCQ00610 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CLTCQ00610 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CLTCQ00610 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CLTCQ00610 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CLTCQ00610 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CLTCQ00610 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CLTCQ00610 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CLTCQ00610 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CLTCQ00610 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLTCQ00610 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLTCQ00610 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLTCQ00610 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLTCQ00610 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
CLTCQ00610 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLTCQ00610 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CLTCQ00610 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CLTCQ00610 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
CLTCQ00610 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CLTCQ00610 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CLTCQ00610 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CLTCQ00610 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CLTCQ00610 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CLTCQ00610 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CLTCQ00610 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CLTCQ00610 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CLTCQ00610 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CLTCQ00610 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CLTCQ00610 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CLTCQ00610 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CLTCQ00610 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CLTCQ00610 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CLTCQ00610 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CLTCQ00610 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CLTCQ00610 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CLTCQ00610 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
CLTCQ00610 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
CLTCQ00610 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
CLTCQ00610 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
CLTCQ00610 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
CLTCQ00610 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
CLTCQ00610 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CLTCQ00610 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLTCQ00610 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLTCQ00610 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLTCQ00610 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CLTCQ00610 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CLTCQ00610 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CLTCQ00610 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CLTCQ00610 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CLTCQ00610 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CLTCQ00610 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CLTCQ00610 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CLTCQ00610 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CLTCQ00610 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.46
CLTCQ00610 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CLTCQ00610 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CLTCQ00610 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CLTCQ00610 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CLTCQ00610 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
CLTCQ00610 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
CLTCQ00610 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CLTCQ00610 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CLTCQ00610 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms