Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK16Q00536 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms