Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFAMQ00059 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFAMQ00059 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFAMQ00059 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFAMQ00059 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFAMQ00059 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFAMQ00059 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFAMQ00059 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TFAMQ00059 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFAMQ00059 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFAMQ00059 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFAMQ00059 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFAMQ00059 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFAMQ00059 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TFAMQ00059 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFAMQ00059 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFAMQ00059 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFAMQ00059 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFAMQ00059 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFAMQ00059 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFAMQ00059 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFAMQ00059 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFAMQ00059 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TFAMQ00059 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFAMQ00059 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFAMQ00059 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFAMQ00059 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFAMQ00059 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TFAMQ00059 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms