Protein–RNA interactions for Protein: P98179

RBM3, RNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM3P98179 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBM3P98179 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBM3P98179 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBM3P98179 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBM3P98179 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBM3P98179 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBM3P98179 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBM3P98179 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBM3P98179 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBM3P98179 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RBM3P98179 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBM3P98179 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBM3P98179 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBM3P98179 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBM3P98179 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBM3P98179 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBM3P98179 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBM3P98179 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBM3P98179 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBM3P98179 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBM3P98179 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBM3P98179 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBM3P98179 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBM3P98179 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBM3P98179 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBM3P98179 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBM3P98179 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBM3P98179 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBM3P98179 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBM3P98179 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBM3P98179 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBM3P98179 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBM3P98179 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBM3P98179 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBM3P98179 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBM3P98179 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBM3P98179 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBM3P98179 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBM3P98179 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBM3P98179 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBM3P98179 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM3P98179 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM3P98179 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM3P98179 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM3P98179 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM3P98179 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM3P98179 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM3P98179 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM3P98179 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM3P98179 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM3P98179 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM3P98179 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM3P98179 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM3P98179 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM3P98179 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM3P98179 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM3P98179 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM3P98179 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM3P98179 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM3P98179 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM3P98179 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM3P98179 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM3P98179 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM3P98179 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM3P98179 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM3P98179 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM3P98179 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM3P98179 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM3P98179 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM3P98179 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM3P98179 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM3P98179 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM3P98179 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM3P98179 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM3P98179 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM3P98179 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM3P98179 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM3P98179 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBM3P98179 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBM3P98179 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM3P98179 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM3P98179 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM3P98179 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM3P98179 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM3P98179 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM3P98179 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM3P98179 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM3P98179 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM3P98179 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM3P98179 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM3P98179 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM3P98179 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM3P98179 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM3P98179 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM3P98179 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM3P98179 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM3P98179 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM3P98179 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM3P98179 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBM3P98179 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms