Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
FGD1P98174 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGD1P98174 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGD1P98174 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
FGD1P98174 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD1P98174 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD1P98174 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD1P98174 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD1P98174 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FGD1P98174 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FGD1P98174 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FGD1P98174 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGD1P98174 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGD1P98174 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGD1P98174 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
FGD1P98174 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGD1P98174 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGD1P98174 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGD1P98174 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FGD1P98174 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FGD1P98174 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FGD1P98174 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD1P98174 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD1P98174 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD1P98174 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD1P98174 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD1P98174 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD1P98174 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD1P98174 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD1P98174 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD1P98174 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD1P98174 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD1P98174 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGD1P98174 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGD1P98174 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGD1P98174 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGD1P98174 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGD1P98174 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGD1P98174 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGD1P98174 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FGD1P98174 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
FGD1P98174 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FGD1P98174 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FGD1P98174 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FGD1P98174 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FGD1P98174 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FGD1P98174 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FGD1P98174 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FGD1P98174 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FGD1P98174 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FGD1P98174 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FGD1P98174 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FGD1P98174 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FGD1P98174 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FGD1P98174 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FGD1P98174 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FGD1P98174 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FGD1P98174 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FGD1P98174 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FGD1P98174 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FGD1P98174 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FGD1P98174 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
FGD1P98174 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FGD1P98174 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FGD1P98174 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FGD1P98174 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FGD1P98174 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FGD1P98174 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FGD1P98174 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FGD1P98174 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FGD1P98174 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FGD1P98174 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGD1P98174 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGD1P98174 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGD1P98174 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGD1P98174 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGD1P98174 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FGD1P98174 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FGD1P98174 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FGD1P98174 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FGD1P98174 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FGD1P98174 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FGD1P98174 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FGD1P98174 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FGD1P98174 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FGD1P98174 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FGD1P98174 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FGD1P98174 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FGD1P98174 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FGD1P98174 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FGD1P98174 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
FGD1P98174 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
FGD1P98174 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FGD1P98174 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FGD1P98174 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FGD1P98174 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FGD1P98174 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
FGD1P98174 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FGD1P98174 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FGD1P98174 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms