Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smyd1P97443 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smyd1P97443 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1485.8 ms