Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ElocP83940 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ElocP83940 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ElocP83940 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ElocP83940 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ElocP83940 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ElocP83940 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ElocP83940 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ElocP83940 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ElocP83940 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ElocP83940 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ElocP83940 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ElocP83940 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ElocP83940 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ElocP83940 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ElocP83940 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ElocP83940 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ElocP83940 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ElocP83940 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ElocP83940 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ElocP83940 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ElocP83940 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ElocP83940 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ElocP83940 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ElocP83940 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ElocP83940 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ElocP83940 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ElocP83940 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ElocP83940 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ElocP83940 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ElocP83940 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ElocP83940 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ElocP83940 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ElocP83940 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ElocP83940 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ElocP83940 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ElocP83940 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ElocP83940 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ElocP83940 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ElocP83940 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ElocP83940 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ElocP83940 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ElocP83940 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ElocP83940 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ElocP83940 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ElocP83940 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ElocP83940 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ElocP83940 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ElocP83940 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ElocP83940 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ElocP83940 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ElocP83940 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ElocP83940 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ElocP83940 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ElocP83940 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ElocP83940 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ElocP83940 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ElocP83940 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ElocP83940 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ElocP83940 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ElocP83940 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ElocP83940 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ElocP83940 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ElocP83940 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ElocP83940 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ElocP83940 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ElocP83940 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ElocP83940 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ElocP83940 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ElocP83940 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ElocP83940 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ElocP83940 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ElocP83940 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ElocP83940 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ElocP83940 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ElocP83940 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ElocP83940 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ElocP83940 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ElocP83940 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ElocP83940 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ElocP83940 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ElocP83940 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ElocP83940 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ElocP83940 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ElocP83940 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ElocP83940 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ElocP83940 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ElocP83940 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ElocP83940 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ElocP83940 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ElocP83940 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ElocP83940 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ElocP83940 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ElocP83940 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ElocP83940 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ElocP83940 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ElocP83940 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ElocP83940 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ElocP83940 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ElocP83940 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms