Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MRPS9P82933 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPS9P82933 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPS9P82933 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms