Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TMF1P82094 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TMF1P82094 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TMF1P82094 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TMF1P82094 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TMF1P82094 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TMF1P82094 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TMF1P82094 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
TMF1P82094 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
TMF1P82094 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TMF1P82094 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
TMF1P82094 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TMF1P82094 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TMF1P82094 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TMF1P82094 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TMF1P82094 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TMF1P82094 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TMF1P82094 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TMF1P82094 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TMF1P82094 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TMF1P82094 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TMF1P82094 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TMF1P82094 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TMF1P82094 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TMF1P82094 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TMF1P82094 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
TMF1P82094 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TMF1P82094 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TMF1P82094 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
TMF1P82094 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TMF1P82094 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TMF1P82094 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TMF1P82094 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TMF1P82094 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
TMF1P82094 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
TMF1P82094 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TMF1P82094 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TMF1P82094 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TMF1P82094 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TMF1P82094 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TMF1P82094 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TMF1P82094 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TMF1P82094 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TMF1P82094 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
TMF1P82094 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TMF1P82094 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TMF1P82094 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TMF1P82094 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TMF1P82094 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
TMF1P82094 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TMF1P82094 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TMF1P82094 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TMF1P82094 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TMF1P82094 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TMF1P82094 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TMF1P82094 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TMF1P82094 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TMF1P82094 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TMF1P82094 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TMF1P82094 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TMF1P82094 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TMF1P82094 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TMF1P82094 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TMF1P82094 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TMF1P82094 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
TMF1P82094 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TMF1P82094 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TMF1P82094 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TMF1P82094 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TMF1P82094 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TMF1P82094 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
TMF1P82094 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TMF1P82094 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TMF1P82094 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TMF1P82094 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TMF1P82094 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TMF1P82094 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TMF1P82094 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TMF1P82094 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TMF1P82094 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TMF1P82094 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TMF1P82094 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
TMF1P82094 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TMF1P82094 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TMF1P82094 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TMF1P82094 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TMF1P82094 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TMF1P82094 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TMF1P82094 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
TMF1P82094 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TMF1P82094 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TMF1P82094 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TMF1P82094 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TMF1P82094 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
TMF1P82094 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TMF1P82094 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TMF1P82094 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TMF1P82094 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TMF1P82094 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TMF1P82094 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms