Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Otx1P80205 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Otx1P80205 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Otx1P80205 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Otx1P80205 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Otx1P80205 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Otx1P80205 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Otx1P80205 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Otx1P80205 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Otx1P80205 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Otx1P80205 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Otx1P80205 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Otx1P80205 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Otx1P80205 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Otx1P80205 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otx1P80205 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otx1P80205 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Otx1P80205 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otx1P80205 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otx1P80205 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otx1P80205 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otx1P80205 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otx1P80205 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otx1P80205 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otx1P80205 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otx1P80205 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otx1P80205 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otx1P80205 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otx1P80205 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otx1P80205 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otx1P80205 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otx1P80205 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Otx1P80205 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otx1P80205 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otx1P80205 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otx1P80205 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otx1P80205 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otx1P80205 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otx1P80205 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otx1P80205 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otx1P80205 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otx1P80205 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otx1P80205 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otx1P80205 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otx1P80205 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otx1P80205 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms