Protein–RNA interactions for Protein: P78549

NTHL1, Endonuclease III-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1P78549 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms