Protein–RNA interactions for Protein: P70408

Cdh10, Cadherin-10, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh10P70408 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdh10P70408 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdh10P70408 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdh10P70408 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdh10P70408 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdh10P70408 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdh10P70408 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdh10P70408 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdh10P70408 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms