Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plxna3P70208 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plxna3P70208 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plxna3P70208 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Plxna3P70208 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Plxna3P70208 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Plxna3P70208 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Plxna3P70208 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plxna3P70208 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plxna3P70208 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plxna3P70208 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plxna3P70208 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Plxna3P70208 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Plxna3P70208 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Plxna3P70208 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Plxna3P70208 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plxna3P70208 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plxna3P70208 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plxna3P70208 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plxna3P70208 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plxna3P70208 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plxna3P70208 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plxna3P70208 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Plxna3P70208 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Plxna3P70208 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Plxna3P70208 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Plxna3P70208 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Plxna3P70208 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Plxna3P70208 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Plxna3P70208 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Plxna3P70208 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Plxna3P70208 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Plxna3P70208 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Plxna3P70208 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Plxna3P70208 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Plxna3P70208 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Plxna3P70208 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Plxna3P70208 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Plxna3P70208 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Plxna3P70208 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Plxna3P70208 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Plxna3P70208 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Plxna3P70208 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Plxna3P70208 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Plxna3P70208 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Plxna3P70208 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Plxna3P70208 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Plxna3P70208 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Plxna3P70208 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Plxna3P70208 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Plxna3P70208 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Plxna3P70208 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Plxna3P70208 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plxna3P70208 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plxna3P70208 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Plxna3P70208 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Plxna3P70208 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Plxna3P70208 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Plxna3P70208 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Plxna3P70208 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plxna3P70208 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plxna3P70208 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Plxna3P70208 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plxna3P70208 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plxna3P70208 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms