Protein–RNA interactions for Protein: P70194

Clec4f, C-type lectin domain family 4 member F, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4fP70194 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec4fP70194 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec4fP70194 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clec4fP70194 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clec4fP70194 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clec4fP70194 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clec4fP70194 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec4fP70194 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec4fP70194 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec4fP70194 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec4fP70194 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec4fP70194 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec4fP70194 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec4fP70194 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec4fP70194 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clec4fP70194 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec4fP70194 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec4fP70194 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms