Protein–RNA interactions for Protein: P70166

Cpeb1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpeb1P70166 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpeb1P70166 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpeb1P70166 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpeb1P70166 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpeb1P70166 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpeb1P70166 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpeb1P70166 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpeb1P70166 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpeb1P70166 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpeb1P70166 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpeb1P70166 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpeb1P70166 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpeb1P70166 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpeb1P70166 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpeb1P70166 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpeb1P70166 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpeb1P70166 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpeb1P70166 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpeb1P70166 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpeb1P70166 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpeb1P70166 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpeb1P70166 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpeb1P70166 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms