Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubb4bP68372 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tubb4bP68372 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tubb4bP68372 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tubb4bP68372 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tubb4bP68372 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubb4bP68372 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubb4bP68372 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubb4bP68372 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubb4bP68372 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubb4bP68372 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb4bP68372 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb4bP68372 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb4bP68372 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubb4bP68372 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubb4bP68372 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubb4bP68372 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubb4bP68372 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubb4bP68372 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubb4bP68372 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tubb4bP68372 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tubb4bP68372 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubb4bP68372 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms