Protein–RNA interactions for Protein: P67809

YBX1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1P67809 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YBX1P67809 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YBX1P67809 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YBX1P67809 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YBX1P67809 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YBX1P67809 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YBX1P67809 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
YBX1P67809 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YBX1P67809 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YBX1P67809 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YBX1P67809 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YBX1P67809 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YBX1P67809 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YBX1P67809 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YBX1P67809 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YBX1P67809 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YBX1P67809 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YBX1P67809 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YBX1P67809 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YBX1P67809 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YBX1P67809 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YBX1P67809 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YBX1P67809 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YBX1P67809 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YBX1P67809 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YBX1P67809 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YBX1P67809 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
YBX1P67809 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YBX1P67809 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YBX1P67809 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YBX1P67809 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YBX1P67809 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YBX1P67809 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YBX1P67809 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YBX1P67809 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YBX1P67809 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
YBX1P67809 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YBX1P67809 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YBX1P67809 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YBX1P67809 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YBX1P67809 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YBX1P67809 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YBX1P67809 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YBX1P67809 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YBX1P67809 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YBX1P67809 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YBX1P67809 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YBX1P67809 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YBX1P67809 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YBX1P67809 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YBX1P67809 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YBX1P67809 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YBX1P67809 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YBX1P67809 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YBX1P67809 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YBX1P67809 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YBX1P67809 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YBX1P67809 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YBX1P67809 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YBX1P67809 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YBX1P67809 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YBX1P67809 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YBX1P67809 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YBX1P67809 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YBX1P67809 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
YBX1P67809 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YBX1P67809 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YBX1P67809 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YBX1P67809 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YBX1P67809 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YBX1P67809 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YBX1P67809 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YBX1P67809 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YBX1P67809 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YBX1P67809 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YBX1P67809 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YBX1P67809 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YBX1P67809 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YBX1P67809 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YBX1P67809 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YBX1P67809 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YBX1P67809 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YBX1P67809 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YBX1P67809 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YBX1P67809 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YBX1P67809 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YBX1P67809 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YBX1P67809 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YBX1P67809 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YBX1P67809 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YBX1P67809 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YBX1P67809 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YBX1P67809 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YBX1P67809 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YBX1P67809 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YBX1P67809 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YBX1P67809 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YBX1P67809 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YBX1P67809 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YBX1P67809 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms