Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPNP63162 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPNP63162 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms