Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl30P62889 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms