Protein–RNA interactions for Protein: P62878

Rbx1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbx1P62878 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbx1P62878 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbx1P62878 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbx1P62878 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms