Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS25P62851 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS25P62851 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS25P62851 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS25P62851 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS25P62851 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS25P62851 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS25P62851 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS25P62851 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS25P62851 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS25P62851 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS25P62851 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS25P62851 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS25P62851 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS25P62851 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS25P62851 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS25P62851 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS25P62851 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS25P62851 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS25P62851 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS25P62851 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS25P62851 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS25P62851 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS25P62851 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS25P62851 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS25P62851 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS25P62851 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS25P62851 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS25P62851 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS25P62851 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS25P62851 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS25P62851 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS25P62851 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS25P62851 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS25P62851 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS25P62851 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS25P62851 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS25P62851 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS25P62851 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS25P62851 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS25P62851 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPS25P62851 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS25P62851 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS25P62851 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS25P62851 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS25P62851 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS25P62851 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS25P62851 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS25P62851 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS25P62851 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS25P62851 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS25P62851 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS25P62851 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS25P62851 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS25P62851 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS25P62851 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS25P62851 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS25P62851 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS25P62851 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS25P62851 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS25P62851 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS25P62851 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS25P62851 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS25P62851 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS25P62851 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS25P62851 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS25P62851 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS25P62851 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS25P62851 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS25P62851 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS25P62851 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS25P62851 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS25P62851 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS25P62851 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS25P62851 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS25P62851 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS25P62851 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS25P62851 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS25P62851 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS25P62851 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS25P62851 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS25P62851 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPS25P62851 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPS25P62851 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS25P62851 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS25P62851 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS25P62851 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS25P62851 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS25P62851 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS25P62851 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS25P62851 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS25P62851 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS25P62851 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS25P62851 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS25P62851 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS25P62851 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS25P62851 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS25P62851 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS25P62851 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS25P62851 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1126.4 ms