Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VSNL1P62760 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VSNL1P62760 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VSNL1P62760 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VSNL1P62760 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VSNL1P62760 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VSNL1P62760 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VSNL1P62760 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VSNL1P62760 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VSNL1P62760 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VSNL1P62760 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VSNL1P62760 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VSNL1P62760 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VSNL1P62760 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VSNL1P62760 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VSNL1P62760 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VSNL1P62760 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VSNL1P62760 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VSNL1P62760 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VSNL1P62760 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VSNL1P62760 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VSNL1P62760 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VSNL1P62760 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VSNL1P62760 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VSNL1P62760 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSNL1P62760 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms