Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SnrpfP62307 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SnrpfP62307 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SnrpfP62307 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SnrpfP62307 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SnrpfP62307 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SnrpfP62307 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SnrpfP62307 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SnrpfP62307 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SnrpfP62307 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SnrpfP62307 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SnrpfP62307 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SnrpfP62307 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SnrpfP62307 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SnrpfP62307 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SnrpfP62307 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SnrpfP62307 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SnrpfP62307 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SnrpfP62307 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SnrpfP62307 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SnrpfP62307 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SnrpfP62307 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SnrpfP62307 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SnrpfP62307 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms