Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNRPEP62304 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms