Protein–RNA interactions for Protein: P62269

RPS18, 40S ribosomal protein S18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS18P62269 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS18P62269 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS18P62269 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS18P62269 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS18P62269 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS18P62269 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS18P62269 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS18P62269 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS18P62269 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS18P62269 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS18P62269 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS18P62269 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS18P62269 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS18P62269 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS18P62269 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS18P62269 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS18P62269 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS18P62269 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS18P62269 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS18P62269 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS18P62269 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS18P62269 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS18P62269 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS18P62269 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS18P62269 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS18P62269 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS18P62269 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS18P62269 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS18P62269 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS18P62269 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS18P62269 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS18P62269 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS18P62269 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS18P62269 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS18P62269 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS18P62269 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS18P62269 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS18P62269 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS18P62269 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS18P62269 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS18P62269 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS18P62269 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS18P62269 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS18P62269 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS18P62269 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS18P62269 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS18P62269 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS18P62269 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS18P62269 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS18P62269 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS18P62269 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS18P62269 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS18P62269 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS18P62269 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS18P62269 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS18P62269 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS18P62269 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS18P62269 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS18P62269 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS18P62269 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS18P62269 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS18P62269 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS18P62269 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS18P62269 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS18P62269 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS18P62269 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS18P62269 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS18P62269 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS18P62269 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS18P62269 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS18P62269 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS18P62269 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS18P62269 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS18P62269 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS18P62269 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS18P62269 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS18P62269 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS18P62269 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS18P62269 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS18P62269 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS18P62269 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS18P62269 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS18P62269 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS18P62269 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS18P62269 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS18P62269 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS18P62269 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS18P62269 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS18P62269 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS18P62269 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS18P62269 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS18P62269 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS18P62269 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS18P62269 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS18P62269 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS18P62269 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS18P62269 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS18P62269 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS18P62269 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS18P62269 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms