Protein–RNA interactions for Protein: P62140

PPP1CB, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CBP62140 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP1CBP62140 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP1CBP62140 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PPP1CBP62140 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PPP1CBP62140 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP1CBP62140 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP1CBP62140 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP1CBP62140 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PPP1CBP62140 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP1CBP62140 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP1CBP62140 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP1CBP62140 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP1CBP62140 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP1CBP62140 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP1CBP62140 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP1CBP62140 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP1CBP62140 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP1CBP62140 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP1CBP62140 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP1CBP62140 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP1CBP62140 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP1CBP62140 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP1CBP62140 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP1CBP62140 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP1CBP62140 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP1CBP62140 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP1CBP62140 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP1CBP62140 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PPP1CBP62140 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP1CBP62140 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP1CBP62140 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPP1CBP62140 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP1CBP62140 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PPP1CBP62140 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP1CBP62140 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP1CBP62140 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP1CBP62140 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PPP1CBP62140 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP1CBP62140 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP1CBP62140 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP1CBP62140 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP1CBP62140 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms