Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPZ1P61923 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPZ1P61923 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms