Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vbp1P61759 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vbp1P61759 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.8 ms