Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-16P61578 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-16P61578 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-16P61578 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-16P61578 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-16P61578 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-16P61578 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-16P61578 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-16P61578 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-16P61578 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-16P61578 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-16P61578 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-16P61578 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-16P61578 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-16P61578 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-16P61578 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-16P61578 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-16P61578 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-16P61578 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-16P61578 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-16P61578 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-16P61578 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-16P61578 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVK-16P61578 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVK-16P61578 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVK-16P61578 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms