Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCE1P61221 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCE1P61221 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms