Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2NP61088 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2NP61088 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2NP61088 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2NP61088 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2NP61088 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2NP61088 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE2NP61088 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE2NP61088 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE2NP61088 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE2NP61088 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2NP61088 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2NP61088 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2NP61088 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2NP61088 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2NP61088 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2NP61088 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2NP61088 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2NP61088 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2NP61088 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2NP61088 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2NP61088 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2NP61088 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE2NP61088 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2NP61088 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2NP61088 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms