Protein–RNA interactions for Protein: P60603

Romo1, Reactive oxygen species modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Romo1P60603 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Romo1P60603 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Romo1P60603 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Romo1P60603 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Romo1P60603 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Romo1P60603 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Romo1P60603 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Romo1P60603 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Romo1P60603 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Romo1P60603 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Romo1P60603 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Romo1P60603 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Romo1P60603 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Romo1P60603 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Romo1P60603 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Romo1P60603 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Romo1P60603 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Romo1P60603 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Romo1P60603 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Romo1P60603 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Romo1P60603 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Romo1P60603 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Romo1P60603 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Romo1P60603 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Romo1P60603 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Romo1P60603 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Romo1P60603 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Romo1P60603 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Romo1P60603 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Romo1P60603 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Romo1P60603 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Romo1P60603 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Romo1P60603 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Romo1P60603 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Romo1P60603 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Romo1P60603 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Romo1P60603 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Romo1P60603 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Romo1P60603 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Romo1P60603 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Romo1P60603 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Romo1P60603 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Romo1P60603 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Romo1P60603 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms