Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pcmtd1P59913 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcmtd1P59913 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcmtd1P59913 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms